万能エンコードソフト aviutl私が常用しているのはaviutlです。スクリプトに抵抗ないならavisynthの方が応用が利くかもしれません。さてaviutlですがこいつを使えば様々な形式の動画の再エンコードも可能になります。また抜いたTSを読んでPS3で再生可能な(h.264 aac).mp4形式の動画作成も可能です。
まず本体はこちらからダウンロードしましょう。一番上の最新版を落として問題ないはず。
AviUtlのお部屋使い方はこちらを見て初期設定をしましょう。
初心者の為のAviUtl講座後は希望のプラグインやフィルターを入れて、解像度の設定、入力プラグイン順序、フィルター順序の設定をすませましょう。お勧めのプラグイン(フィルター)は以下。
x264GUI出力プラグイン
パンディング低減フィルター
自動フィールドシフト
自動24fps化 とかです。探せばすぐ出てきます。